Домовая церковь при консерватории Императорского русского музыкального общества была создана в 1891–1896 годах при перестройке здания бывшего Большого театра для открытой в 1862 году консерватории.
В августе 1923 года иконостас и оставшаяся церковная утварь были перенесены в Николо–Богоявленский собор, а в самом храме был устроен концертный зал.
В 1930–х годах в помещении бывшего храма были возведены перегородки и перекрытия для устройства читального зала с книгохранилищем на третьем и учебных классов на четвёртом этажах здания.
В 1992 году в плане ремонтно–реставрационных работ была предусмотрена реконструкция храма, но она осталась нереализованной.
В 2015 г. начался капитальный ремонт здания консерватории, предполагающий также восстановление её храма.